На 30 юни 1964 г., непосредствено преди независимостта, британската територия Nyasaland, преименувана на Малави при независимост, получи герб, който замени знаме на знаме от по-ранен британски колониален произход. Новият дизайн показа леопард и лъв с щит между тях. На щита беше изобразена стилизирана река, лъв и изгряващо жълто слънце. Националният девиз „Единство и свобода“ се появи под мишниците, а отгоре имаше жълт диск, увенчан от плешив орел.
Тест за изследване на Африка: факт или измислица? В Кения никога не вали сняг.Първото национално знаме на Малави е издигнато по време на независимостта, на 6 юли 1964 г. Дизайнът на знамето, три равни хоризонтални ивици от черно, червено и зелено, съответства на знамето, използвано от Малави конгресната партия, тогава доминиращата политическа сила в страната. Ивиците върху флага символизираха съответно африканския народ на страната, кръвта на мъчениците за независимост и вечнозелената природа на Малави. Името на страната означава „пламтящи води“, отнасящо се до залязващото слънце на езерото Няса (известно в Малави като езерото Малави), а към горната ивица на националното знаме е добавено червено полуслънце, за да се разграничи от партийното знаме.
Правителството на прес. Bingu wa Mutharika предложи модификация на националното знаме и новият дизайн беше приет на 29 юли 2010 г. и за пръв път издигнат на 7 август. Ивиците в знамето бяха пренаредени в червено-черно-зелено и изгряващото полуслънце беше премахнато . На негово място се появи пълно бяло слънце с излъчвани от него 45 лъча, центрирано в знамето. Обосновката, дадена за промяната, беше, че докато полуслънцето символизираше новата нововъзникваща държава, пълно слънце означаваше зрелостта на Малави като нация.
Новият флаг обаче не се хареса на голям сегмент от населението на Малави, който предпочита оригиналното знаме от 1964 г. Мутарика почина през април 2012 г. и неговият наследник Джойс Банда обеща да възстанови старото знаме. Парламентът на Малави гласува за възстановяването му като национално знаме на 28 май и той отново се използва.
