Когато съветските власти дойдоха на власт в Западен Туркестан, обещавайки равенство и развитие за всички етнически групи, киргизките хора получиха своя автономна област през 1924 г. През 1926 г. тя беше издигната до статут на автономна република, а през 1936 г. стана съюз република в състава на СССР През 1953 г. Киргиз SSR прие модифицирана версия на съветското Червено знаме чрез добавяне на синя хоризонтална ивица в центъра с бяла рамка. След като Киргизстан провъзгласи независимостта си на 31 август 1991 г., той продължи да използва съветското си знаме до 3 март 1992 г.
Фонът на новото знаме, което се използва и до днес, също е червено, но се твърди, че произтича от знаме, носено от националния герой на Киргизия Манас Благородният. В центъра на знамето има жълто слънце с 40 лъча, съответстващо на последователите на Манас и племената, които той обединява; неговите допълнителни символни атрибути са светлина, благородство и вечност. На това слънце има червено-жълта емблема с два кръстосани комплекта от по три линии, всички в рамките на пръстен. Това е стилизирана гледка към покрива на традиционния киргизки дом, юрта. Малко киргизи все още живеят в юрти, но до средата на 20-ти век мнозинството от този номадски народ създава юрти, където и да пътува. Символичното значение на този дизайн е сложно: законът за знамето говори за произхода на живота, единството на времето и пространството, историята на киргизките хора, солидарността и огнището и дома.
